MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 101098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018078	GCAGC	2	10	48700	48709	20 %	0 %	40 %	40 %	392430453
1002	NC_018078	GTC	2	6	48716	48721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430453
1003	NC_018078	GGC	2	6	48724	48729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430453
1004	NC_018078	TCG	2	6	48759	48764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430453
1005	NC_018078	CCCGA	2	10	48783	48792	20 %	0 %	20 %	60 %	392430453
1006	NC_018078	GCCG	2	8	48805	48812	0 %	0 %	50 %	50 %	392430453
1007	NC_018078	AGC	2	6	48849	48854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430453
1008	NC_018078	AAG	2	6	48981	48986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430453
1009	NC_018078	CGG	2	6	49029	49034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430453
1010	NC_018078	G	6	6	49060	49065	0 %	0 %	100 %	0 %	392430453
1011	NC_018078	TGC	2	6	49068	49073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430453
1012	NC_018078	GT	3	6	49150	49155	0 %	50 %	50 %	0 %	392430454
1013	NC_018078	GC	3	6	49185	49190	0 %	0 %	50 %	50 %	392430454
1014	NC_018078	CGA	2	6	49225	49230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430454
1015	NC_018078	CGG	2	6	49270	49275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430454
1016	NC_018078	CGA	2	6	49298	49303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430454
1017	NC_018078	GCC	2	6	49304	49309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430454
1018	NC_018078	CGT	2	6	49345	49350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430454
1019	NC_018078	CGG	2	6	49422	49427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430454
1020	NC_018078	CGC	2	6	49441	49446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430454
1021	NC_018078	GCT	2	6	49555	49560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430454
1022	NC_018078	CGG	2	6	49561	49566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430454
1023	NC_018078	CGA	2	6	49606	49611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430454
1024	NC_018078	GCG	2	6	49750	49755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430454
1025	NC_018078	TCC	2	6	49767	49772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430454
1026	NC_018078	CGA	2	6	49831	49836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430454
1027	NC_018078	CCG	3	9	49866	49874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430454
1028	NC_018078	GCC	2	6	49901	49906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430454
1029	NC_018078	CAGCG	2	10	49908	49917	20 %	0 %	40 %	40 %	392430454
1030	NC_018078	CAGC	2	8	49990	49997	25 %	0 %	25 %	50 %	392430454
1031	NC_018078	TCG	2	6	50025	50030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430454
1032	NC_018078	GAT	2	6	50129	50134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430455
1033	NC_018078	GC	5	10	50149	50158	0 %	0 %	50 %	50 %	392430455
1034	NC_018078	GTC	2	6	50162	50167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430455
1035	NC_018078	GCT	2	6	50173	50178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430455
1036	NC_018078	CGGG	2	8	50179	50186	0 %	0 %	75 %	25 %	392430455
1037	NC_018078	TCA	2	6	50191	50196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430455
1038	NC_018078	CCG	2	6	50223	50228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430455
1039	NC_018078	GCC	2	6	50253	50258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430455
1040	NC_018078	GAT	2	6	50270	50275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430455
1041	NC_018078	GCCG	2	8	50279	50286	0 %	0 %	50 %	50 %	392430455
1042	NC_018078	TCG	2	6	50382	50387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430455
1043	NC_018078	TCT	2	6	50479	50484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430455
1044	NC_018078	GCC	2	6	50531	50536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430455
1045	NC_018078	CGC	2	6	50569	50574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430455
1046	NC_018078	GGTG	2	8	50602	50609	0 %	25 %	75 %	0 %	392430455
1047	NC_018078	TCG	2	6	50611	50616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430455
1048	NC_018078	TCA	2	6	50637	50642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430455
1049	NC_018078	CGA	2	6	50644	50649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430455
1050	NC_018078	CTT	2	6	50672	50677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430455
1051	NC_018078	TCC	2	6	50772	50777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430455
1052	NC_018078	CCT	2	6	50818	50823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430455
1053	NC_018078	GAC	2	6	50834	50839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430455
1054	NC_018078	GTA	2	6	50879	50884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430455
1055	NC_018078	GTT	2	6	50960	50965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430455
1056	NC_018078	CTT	2	6	51005	51010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430455
1057	NC_018078	CGC	2	6	51026	51031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430455
1058	NC_018078	GTC	2	6	51101	51106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430455
1059	NC_018078	GTA	3	9	51113	51121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430455
1060	NC_018078	GCCGAC	2	12	51155	51166	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392430455
1061	NC_018078	CTCA	2	8	51218	51225	25 %	25 %	0 %	50 %	392430455
1062	NC_018078	CGG	2	6	51298	51303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430456
1063	NC_018078	TGC	2	6	51311	51316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430456
1064	NC_018078	CGCT	2	8	51357	51364	0 %	25 %	25 %	50 %	392430456
1065	NC_018078	CTG	2	6	51414	51419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430456
1066	NC_018078	GGC	2	6	51466	51471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430456
1067	NC_018078	GAA	2	6	51518	51523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430456
1068	NC_018078	CGT	2	6	51544	51549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430456
1069	NC_018078	TG	3	6	51559	51564	0 %	50 %	50 %	0 %	392430456
1070	NC_018078	CCA	2	6	51577	51582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430456
1071	NC_018078	CGT	2	6	51627	51632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430456
1072	NC_018078	CGC	2	6	51636	51641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430456
1073	NC_018078	GGC	2	6	51659	51664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430456
1074	NC_018078	CAG	2	6	51746	51751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430456
1075	NC_018078	CCG	2	6	51988	51993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430457
1076	NC_018078	ACAACG	3	18	52010	52027	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	392430457
1077	NC_018078	GTG	2	6	52036	52041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430457
1078	NC_018078	CGA	2	6	52058	52063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430457
1079	NC_018078	ATG	2	6	52123	52128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430457
1080	NC_018078	GCC	2	6	52215	52220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430457
1081	NC_018078	GGTA	2	8	52223	52230	25 %	25 %	50 %	0 %	392430457
1082	NC_018078	CGG	2	6	52243	52248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430457
1083	NC_018078	CCG	2	6	52253	52258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430457
1084	NC_018078	CAG	2	6	52344	52349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430457
1085	NC_018078	CCG	2	6	52360	52365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430457
1086	NC_018078	CAC	2	6	52395	52400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430457
1087	NC_018078	CAG	2	6	52494	52499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430457
1088	NC_018078	CCA	2	6	52604	52609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430457
1089	NC_018078	TCC	2	6	52669	52674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430457
1090	NC_018078	CGT	2	6	52700	52705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430457
1091	NC_018078	CG	3	6	52766	52771	0 %	0 %	50 %	50 %	392430457
1092	NC_018078	CTG	2	6	52960	52965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430458
1093	NC_018078	GT	3	6	52991	52996	0 %	50 %	50 %	0 %	392430458
1094	NC_018078	CTG	2	6	53023	53028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430458
1095	NC_018078	CGC	2	6	53031	53036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430458
1096	NC_018078	AGC	2	6	53087	53092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430458
1097	NC_018078	CG	3	6	53145	53150	0 %	0 %	50 %	50 %	392430458
1098	NC_018078	CCG	2	6	53153	53158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430458
1099	NC_018078	CTG	2	6	53170	53175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430458
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1101	NC_018078	ATC	2	6	53237	53242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430458
1102	NC_018078	C	6	6	53283	53288	0 %	0 %	0 %	100 %	392430458
1103	NC_018078	GC	3	6	53314	53319	0 %	0 %	50 %	50 %	392430458
1104	NC_018078	GTC	2	6	53365	53370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430459
1105	NC_018078	GCG	2	6	53373	53378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430459
1106	NC_018078	CG	3	6	53382	53387	0 %	0 %	50 %	50 %	392430459
1107	NC_018078	CGA	2	6	53425	53430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430459
1108	NC_018078	TCC	2	6	53445	53450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430459
1109	NC_018078	GC	3	6	53520	53525	0 %	0 %	50 %	50 %	392430459
1110	NC_018078	CGC	2	6	53538	53543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430459
1111	NC_018078	GAG	2	6	53555	53560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430459
1112	NC_018078	GCC	2	6	53576	53581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430459
1113	NC_018078	CCG	2	6	53594	53599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430459
1114	NC_018078	G	6	6	53601	53606	0 %	0 %	100 %	0 %	392430459
1115	NC_018078	TGG	2	6	53614	53619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430459
1116	NC_018078	GCC	2	6	53638	53643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430459
1117	NC_018078	C	6	6	53648	53653	0 %	0 %	0 %	100 %	392430459
1118	NC_018078	GCCG	2	8	53672	53679	0 %	0 %	50 %	50 %	392430459
1119	NC_018078	CGG	2	6	53760	53765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430459
1120	NC_018078	TCG	2	6	53811	53816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430459
1121	NC_018078	ACCA	2	8	53843	53850	50 %	0 %	0 %	50 %	392430459
1122	NC_018078	CG	3	6	54022	54027	0 %	0 %	50 %	50 %	392430459
1123	NC_018078	AAC	2	6	54038	54043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430459
1124	NC_018078	CGG	2	6	54049	54054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430459
1125	NC_018078	CGA	2	6	54072	54077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430459
1126	NC_018078	CAG	2	6	54083	54088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430459
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1233	NC_018078	CGACC	2	10	58323	58332	20 %	0 %	20 %	60 %	392430462
1234	NC_018078	CGA	2	6	58335	58340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430462
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1238	NC_018078	GCC	2	6	58492	58497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430462
1239	NC_018078	ACC	2	6	58700	58705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430463
1240	NC_018078	TCG	2	6	58713	58718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430463
1241	NC_018078	TCC	2	6	58848	58853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430463
1242	NC_018078	GGC	2	6	58873	58878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430463
1243	NC_018078	G	6	6	58905	58910	0 %	0 %	100 %	0 %	392430463
1244	NC_018078	GCGG	2	8	58926	58933	0 %	0 %	75 %	25 %	392430463
1245	NC_018078	AGC	2	6	58938	58943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430463
1246	NC_018078	TCGAGG	2	12	58983	58994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392430463
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1248	NC_018078	CAA	2	6	59038	59043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430463
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1497	NC_018078	CTG	2	6	73396	73401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430476
1498	NC_018078	TCG	3	9	73434	73442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430476
1499	NC_018078	TGA	2	6	73473	73478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430476
1500	NC_018078	GCC	2	6	73561	73566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430476

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